核酸提取是指將核酸(DNA和RNA)從細(xì)胞中提取出來(lái)的過(guò)程,總的來(lái)說(shuō)包括細(xì)胞裂解、核酸純化及后續(xù)核酸濃度、純度測(cè)定的步驟。根據(jù)原始樣品的種類(lèi)和核酸產(chǎn)物后續(xù)的各種應(yīng)用目的,細(xì)胞裂解和核酸純化步驟有不同的處理方法和要求。
案例一:小鼠基因型判定實(shí)驗(yàn)的模板DNA提取
初始樣品為小鼠尾切段?;蛐团卸▽?shí)驗(yàn)對(duì)DNA模板的濃度、純度要求不高,消化提取過(guò)程相對(duì)簡(jiǎn)單。
1.將1cm尾巴切段置于1.5mL微量離心管中,加入適量裂解液(Lysis buffer)和蛋白酶(Proteinase K)于55~65℃水浴過(guò)夜消化。
2.充分消化后的尾巴樣品加入沉淀液(Precipitation buffer)后用旋渦混勻儀來(lái)使雜質(zhì)蛋白充分沉淀,雜質(zhì)沉淀后通過(guò)離心操作(如4℃,4000*g,5min),取出溶有目標(biāo)DNA的上清液,丟棄雜質(zhì)沉淀。
3.上清液中加入100%異丙醇,小心顛倒離心管30~40次,便可以將產(chǎn)物DNA沉降。離心操作(4℃,10000*g或12000rpm,10min)去除上清。
4.用75%乙醇洗滌兩次DNA產(chǎn)物,待乙醇充分揮發(fā)后,用水或TE緩沖液(Tris-EDTA buffer)收獲DNA模板產(chǎn)物。
進(jìn)行后續(xù)的PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)前,可以使用Nanodrop儀器來(lái)進(jìn)行DNA濃度和純度的測(cè)定來(lái)提高PCR反應(yīng)的成功率。在PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)不順利的情況下,也可以進(jìn)一步對(duì)DNA產(chǎn)品的完整度進(jìn)行檢測(cè),具體方法可以參考核酸檢測(cè)和核酸擴(kuò)增的有關(guān)內(nèi)容。
試劑:裂解液、蛋白酶、沉淀液、異丙醇、乙醇、TE緩沖液
耗材:槍頭、1.5ml微量離心管、(15、50mL)離心管
儀器:旋渦混勻儀、分光光度儀
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